Khoa Thuỷ sản được tách ra từ trường Trung cấp Nông lâm Trung ương và thành lập trường Trung cấp Thuỷ sản Trung ương, đóng tại thị trấn Văn Điển, huyện Thanh Trì, thành phố Hà Nội.

Trường Trung cấp Thuỷ sản Trung ương sáp nhập với Trường Trung cấp Thuỷ sản Hải Phòng thành Trường trung cấp Thuỷ sản Trung ương II-Trực thuộc Tổng cục Thuỷ sản, đóng tại xã Tân Dương, huyện Thuỷ Nguyên, Hải phòng, theo Quyết định số 128 TS/QĐ ngày 23/3/1964

trường được chuyển về xã Đình Bảng, huyện Tiên Sơn, tỉnh Hà Bắc (Nay là Phường Đình Bảng, Thị xã Từ Sơn, tỉnh Bắc Ninh) để gần Trạm Nghiên cứu cá nước ngọt, theo Quyết định số 423 TS/QĐ ngày 31/6/1971.

trường tiếp tục được hợp nhất với trường Bổ túc văn hoá nghiệp vụ Thuỷ sản, thành Trường Trung học Thuỷ sản IV trực thuộc Bộ Thuỷ sản, theo Quyết định số 411/HS – QĐ - TC ngày 07/5/1979 của Bộ Trưởng Bộ Thuỷ sản.

Trường Trung học thuỷ sản IV được nâng cấp thành Trường Cao đẳng Thuỷ sản theo Quyết định số 6768/QĐ - BGD&ĐT của Bộ trưởng Bộ Giáo dục và Đào tạo. Trường Cao đẳng Thuỷ sản ra đời đánh dấu sự trưởng thành về chất sau 45 xây dựng và phát triển, xứng đáng với truyền thống đoàn kết, năng động, sáng tạo và hội nhập của nhà trường. Đồng thời đây cũng là cơ hội để nhà trường xây dựng những chặng đường phát triển trong tương lai, góp phần tích cực vào sự nghiệp CNH, HĐH đất nước.

Sau 50 năm xây dựng và trưởng thành Trường Cao đẳng Thuỷ sản (Nay là trường Cao đẳng Kinh tế, Kỹ thuật và Thủy sản) đã dần đi vào thế phát triển theo hướng ổn định và bền vững, tạo đà để tiếp tục phát triển thành một trường Đại học đa cấp học, đa ngành học, đáp ứng yêu cầu của nền kinh tế thị trường và hội nhập kinh tế quốc tế. Từ thời kỳ đầu giai đoạn 1962-1970, nhà trường chỉ có 1 cấp đào tạo, đến nay Trường đã có 4 cấp đào tạo với hơn 10 ngành học. Nhà tr­ường đã được Đảng, Nhà n­ước, Chính phủ tặng nhiều phần thưởng cao quý: Huân chương Lao động hạng Nhất, Nhì, Ba. Đặc biệt trường đã được Chủ tịch nước Cộng hoà xã hội chủ nghĩa Việt Nam tặng thưởng Huân chương Độc lập hạng Hai, vì đã có thành tích đặc biệt xuất sắc trong sự nghiệp xây dựng và bảo vệ Tổ quốc.

Lễ đón nhận Huân chương Độc lập hạng Ba

Với yêu cầu mới của một trường Cao đẳng, nhà trường tiếp tục được Nhà nước quan tâm đầu tư 3 dự án, đó là: Dự án xây dựng đường và cơ sở hạ tầng; Dự án khu giáo dục thể chất và nhà ký túc xá số 2 trên khu đất mở rộng của trường tại thôn Long Vĩ, Phường Đình Bảng, Thị xã Từ Sơn, tỉnh Bắc Ninh và Dự án nâng cấp Trại Thực nghiệm nuôi trồng Thuỷ sản tại xã Minh Thành, huyện Yên Hưng, tỉnh Quảng Ninh. Thực hiện chủ trương của Đảng và Nhà nước để sớm hoà nhập với cộng đồng quốc tế và khu vực về giáo dục và đào tạo. Nhà trường đã thiết lập quan hệ hợp tác với nhiều tổ chức Quốc tế, các Trường, Viện trên thế giới như: Hiệp hội các Trường Trung học Canada (ACCC); Viện Marine Instritus - Canada, Trường Okalagan University Canada; Viện công nghệ Châu Á - Thái Lan; Trường Cao đẳng Bắc Đại Tây Dương (College of the North Atlantic Canada); Đại học Bắc Úc (Charles Darwin University - Australia); Tổ chức nghiên cứu nông nghiệp quốc tế (ACIAR) - Úc. Kết quả của sự hợp tác quốc tế hơn 10 năm qua là tiền đề quan trọng nhằm đẩy nhanh tốc độ hội nhập và hợp tác trên các lĩnh vực như: Nâng cao năng lực đào tạo nguồn nhân lực, nghiên cứu khoa học, tiếp cận với các chương trình đào tạo tiên tiến và đổi mới phương pháp giảng dạy… Đồng thời từng bước hiện đại hoá trang thiết bị phục vụ giảng dạy, thực hành thực tập, nghiên cứu khoa học cho thầy và trò nhà trường, góp phần thực hiện phương châm trong đào tạo là: Thiết thực, hiệu quả và trực tiếp, đáp ứng yêu cầu hội nhập và hợp tác quốc tế.